再生障礙性貧血的患者根據病情輕重的不同,可以分為急性的再生障礙性貧血和慢性再生障礙性貧血。二者的預后是不同的,絕大多數的慢性再生障礙性貧血的患者,在經過積極的治療以后,病人病情是可以達到緩解的,很多病人有可能能夠獲得治愈,對于慢性的再生障礙性貧血的患者,經常使用雄性激素類的藥物,或者是環孢素類的藥物來進行治療。
對于急性的重型再生障礙性貧血患者,雖然也可以使用免疫抑制劑來進行治療,還可以使用對癥支持療法,但是有很多的患者有可能會發生嚴重的并發癥,比如說嚴重的感染,或者是內臟出血,有接近1/3的患者,有可能會在1年之內死亡。但是也有過半數的患者,有可能通過積極的治療,能夠獲得治愈,所以多數的再生障礙性貧血的患者還是可以治愈的。