一旦確診為瑞特綜合征,即應當積極治療,鑒于瑞特綜合癥的發病與感染有關,應抗炎與對癥綜合治療,急性期為清除腸道和尿道細菌應該使用抗生素治療。抗生素的選擇應根據發病類型,細菌種類而定,一般認為性病型首選四環素和紅霉素,療程應該十到十四天。
而腸病型最好根據腸道菌培養結果選擇敏感性藥物進行治療,抗生素的應用對于瑞特綜合征的病程和預后有一定幫助,針對病人關節以及附著點病變所引起的腫痛,選用非甾體類抗炎藥物。
對癥狀較重的病例在應用非甾體抗炎藥物治療的同時,應積極使用藥物如柳氮磺吡啶和甲氨蝶呤等,結膜炎和皮膚黏膜的病變通常不需要治療,但必須保持局部衛生避免細菌感染。對急性發熱及關節腫痛明顯的病人應臥床休息,加強營養,補充維生素以及攝入足夠的水分。