在臨床上系統性紅斑狼瘡有一定的遺傳因素參與,許多臨床資料表明家庭中某一成員患有系統性紅斑狼瘡,則其他成員的發病率也是有所增加的。
由5%到2%的一級親屬發病在單卵雙生同胞中,如果其中一人發病則另一人發病的可能性為25%到50%左右。對于異卵雙生者若一人患病則另一人患病的幾率為5%,人類遺傳基因研究發現,某些人類白細胞抗原與系統性紅斑狼瘡的發病有關,先天性一些補體的缺乏也易發生系統性紅斑狼瘡。
目前世界上許多風濕病學家正在尋找導致系統性紅斑狼瘡的致病基因,但系統性紅斑狼瘡的發病是多因素的,遺傳因素作為一個內因,還要由某些外因參與才可能引起發病。