慢性小球腎炎本質(zhì)上是免疫介導(dǎo)性的炎癥疾病，雖然它的發(fā)病機(jī)制非常復(fù)雜，但是整體上主要還是與免疫功能紊亂有關(guān)系。
免疫機(jī)制的紊亂是腎小球疾病的始發(fā)機(jī)制，在此基礎(chǔ)上一些炎癥介質(zhì)被調(diào)動(dòng)起來(lái)，比如補(bǔ)體，細(xì)胞因子，活性氧等等，最后會(huì)導(dǎo)致腎小球的損傷，可以導(dǎo)致腎小球類的一些細(xì)胞增生，比如系膜細(xì)胞，系膜的機(jī)制，內(nèi)皮細(xì)胞，都有可能產(chǎn)生增生，也有可能會(huì)導(dǎo)致腎小球的基底膜以及足細(xì)胞的損傷，比如有些免疫復(fù)合物可以沉積到基底膜或者足細(xì)胞上，腎小球的濾過(guò)屏障導(dǎo)致血液從腎小球?yàn)V過(guò)的時(shí)候，血液中的蛋白質(zhì)或者紅細(xì)胞會(huì)露出，這是慢性腎小球腎炎整體上的發(fā)病機(jī)制。
在晚期的時(shí)候可以導(dǎo)致腎小球的實(shí)質(zhì)性細(xì)胞壞死，脫落，凋亡，可以導(dǎo)致纖維結(jié)締組織沉積，造成腎小球硬化，以及腎小管萎縮，腎小管纖維化等等。
