甲狀腺的萎縮性病變多見于慢性淋巴細胞性甲狀腺炎,早期腺體有大量淋巴細胞、漿細胞等炎癥細胞浸潤。久之腺泡受毀損代質以纖維組織,殘余濾泡變得矮小,濾泡萎縮,上皮細胞扁平,泡腔內充滿膠質。
矮小病者由于激素合成障礙,腺體增生肥大外,一般均呈萎縮樣改變,甚而發育不全或缺顱,甲狀腺腫大伴大小不等等。多結節者常見于地方性甲狀腺腫,由于缺碘所致。慢性淋巴細胞性甲狀腺炎后期也可伴有結節,藥物所致者的甲狀腺可呈代償性彌漫性腫大。
原發性甲減由于甲狀腺素減少,對垂體的反饋抑制減弱,而使甲狀腺素細胞增生肥大,嗜堿性粒細胞變性,久之腺垂體增大,甚或發生腺瘤。或同時伴高泌乳素血癥、垂體性甲減患者的垂體萎縮,也可發生腫瘤或肉芽腫。